A Calculadora de Massa de Peptídeo é uma ferramenta especializada usada em bioquímica e biologia molecular para calcular a massa molecular de um peptídeo a partir de sua sequência de aminoácidos. Esta ferramenta é essencial para pesquisadores e cientistas que trabalho com proteínas e peptídeos, pois ajuda a determinar com precisão a massa dos peptídeos, o que é crucial para vários protocolos e procedimentos experimentais.
Calculadora de Fórmula de Massa Peptídica
Cálculo passo a passo:
- Lista de aminoácidos: Comece identificando os aminoácidos presentes na sequência peptídica.
- Massas de aminoácidos: Utilize a massa monoisotópica padrão para cada aminoácido envolvido no peptídeo.
- Soma das massas de aminoácidos: Calcule a massa total somando as massas monoisotópicas de todos os aminoácidos na sequência.
- Ajuste para perda de água: Conta para o massa de água moléculas (18.01528 Da por ligação peptídica) que são perdidas durante a formação das ligações peptídicas.
Massas de aminoácidos:
Aqui estão as massas monoisotópicas dos 20 aminoácidos padrão, que são vitais para os cálculos:
| Aminoácido | Símbolo | Massa Monoisotópica (Da) |
|---|---|---|
| alanina | A | 71.03711 |
| Arginina | R | 156.10111 |
| Asparagina | N | 114.04293 |
| Ácido aspártico | D | 115.02694 |
| Cisteína | C | 103.00919 |
| glutamina | Q | 128.05858 |
| Ácido glutâmico | E | 129.04259 |
| Glycine | G | 57.02146 |
| Histidina | H | 137.05891 |
| Isoleucina | I | 113.08406 |
| Leucina | L | 113.08406 |
| Lisina | K | 128.09496 |
| Metionina | M | 131.04049 |
| fenilalanina | F | 147.06841 |
| Prolina | P | 97.05276 |
| Serina | S | 87.03203 |
| Treonina | T | 101.04768 |
| Triptofano | W | 186.07931 |
| tirosina | Y | 163.06333 |
| Valina | V | 99.06841 |
Cálculo Final:
- Soma das massas de aminoácidos: Σ (massa de cada aminoácido)
- Calcule o número de ligações peptídicas: (n - 1), onde n é o número de aminoácidos no peptídeo.
- Massa do Peptídeo (M): Soma das massas de aminoácidos - (Número de ligações peptídicas * 18.01528 Da)
Tabela de Termos Gerais
| INVERNO | Definição |
|---|---|
| Missa Monoisotópica | A massa de uma molécula usando o isótopo mais abundante de cada elemento. |
| Ligação Peptídica | Um covalente químico ligação que liga dois monômeros de aminoácidos consecutivos ao longo de uma cadeia peptídica ou proteica. |
| Aminoácido | Compostos orgânicos que se combinam para formar proteínas, os blocos de construção da vida. |
| Peptide | Cadeia curta de aminoácidos ligados por ligações peptídicas. |
Exemplo de calculadora de massa de peptídeo
- Massas de aminoácidos:
- Glicina (G): 57.02146 Da
- Alanina (A): 71.03711 Da
- Leucina (L): 113.08406 Da
- Soma das massas de aminoácidos:
- 57.02146 + 71.03711 + 113.08406 = 241.14263 Da
- Número de ligações peptídicas:
- 3 aminoácidos - 1 = 2 ligações peptídicas
- Calcular a massa do peptídeo:
- 241.14263 - (2 * 18.01528) = 205.11207 Da
Este cálculo demonstra como determinar a massa do peptídeo para uma sequência simples.
Perguntas frequentes mais comuns
A precisão é altamente dependente da precisão dos valores de massa de aminoácidos fornecidos. Geralmente é muito confiável para cálculos teóricos.
Não, a calculadora padrão de massa de peptídeos não leva em conta modificações pós-traducionais. Ajustes ou ferramentas adicionais são necessários para tais cálculos.
Para proteínas grandes, a calculadora pode fornecer uma estimativa aproximada, mas métodos mais sofisticados, como espectrometria de massa, são recomendados para maior precisão.