一致係数 (COC) 計算機は、サンプル内で観測された二重交差が予想される二重交差とどの程度一致するかを測定するために使用される遺伝学的ツールです。これは、1 つの交差イベントが近くの別の交差イベントの発生に影響を与える可能性がある遺伝的干渉の現象を研究者が理解するのに役立ちます。この計算は、遺伝子の位置をマッピングし、組み換えを研究するために遺伝学で不可欠です。
一致係数を使用することで、科学者は遺伝継承のメカニズムや染色体における交差イベントに影響を与える要因についての洞察を得ることができます。
一致係数の計算式
一致係数は次の式を使用して計算されます。
COC = (観測された二重交差) / (期待される二重交差)
期待される二重交差の計算
予想される二重交差を決定するには、2 つの遺伝子ペアの個々の組み換え頻度を掛け合わせます。
予想されるダブルクロスオーバー = 組み換え頻度（遺伝子ペア1）×組み換え頻度（遺伝子ペア2）
計算例
- 組み換え頻度:
- 遺伝子ペアAB: 20% (0.2)
- 遺伝子ペアCD: 10% (0.1)
- 予想されるダブルクロスオーバー:
- 0.2 × 0.1 = 0.02 (または 2%)
- 観察された二重クロスオーバー:
- 15 個体のサンプルで 1,000 回の二重交差が観察されると仮定します。
- COC計算:
- COC = 15 / (1,000 × 0.02) = 0.75
解釈
- 1 の: ダブルクロスオーバーは予想どおりの頻度で発生し、干渉がないことを示しています。
- COC < 1: 干渉が存在し、1 つのクロスオーバーが近くにある別のクロスオーバーを阻害していることを意味します。
- COC > 1: まれに観察されますが、1 つのクロスオーバーが別のクロスオーバーを促進する正の干渉を示します。
すぐに使える参照表
一致係数の一般的な値と解釈をまとめた表を以下に示します。
| COC値 | 解釈 |
|---|---|
| 1.0 | 独立した組み合わせ、干渉なし。 |
| <1.0 | 干渉の存在。クロスオーバーは相互に抑制します。 |
| > 1.0 | 正の干渉。クロスオーバーは互いを促進します。 |
この表は、COC 値に基づいて遺伝子組み換えパターンを理解するためのクイック ガイドとして役立ちます。
一致係数計算機の例
次のシナリオの一致係数を計算してみましょう。
- 遺伝子ペアAB間の組み換え頻度: 15% (0.15)
- 遺伝子ペアCD間の組み換え頻度: 5% (0.05)
- 観察された二重交差: 8 個体のサンプル中 500 件。
ステップ1: 予想されるダブルクロスオーバーを計算する
期待される二重交差 = 0.15 × 0.05 = 0.0075 (または 0.75%)
500個体における期待される二重交差数: 0.0075 × 500 = 3.75
ステップ2: COCを計算する
COC = 観測された二重交差 / 期待される二重交差 COC = 8 / 3.75 ≈ 2.13
解釈
COC が 2.13 であることは、XNUMX つのクロスオーバーによって近くにある別のクロスオーバーの可能性が高まる、正の干渉を示唆しています。
最も一般的な FAQ
COC 値が 1 未満の場合、干渉を示し、XNUMX つのクロスオーバー イベントによって近くで別のクロスオーバー イベントが発生する確率が低下します。
これは、遺伝子干渉に関する洞察を提供し、組み換え頻度を分析することで染色体上の遺伝子の相対的な位置をマッピングするのに役立ちます。
まれではありますが、COC が 1 より大きい場合は、XNUMX つのクロスオーバー イベントが近接した別のクロスオーバー イベントの発生を促進する、正の干渉を示している可能性があります。