DNA 配列の逆相補体は、最初に配列全体を逆にし、次に各ヌクレオチドをその相補的な塩基で置き換えることによって生成されます。このプロセスは、DNA 鎖を整列させ、DNA 断片の元の状態を再構築するためのバイオインフォマティクスにおいて重要です。
遺伝子研究において、特に回文配列を扱うときや、異なる DNA 鎖で一致する配列を見つけようとするとき、逆相補体は必要なアラインメントを提供します。 DNA 配列を反転して補完することにより、科学者は反対方向に読み取られた遺伝コードを簡単に比較できます。
逆補数計算機の公式
DNA 配列の逆相補配列の計算には、次の 2 つの主な手順が含まれます。
- 順序を逆にする: シーケンスを逆の順序で書き留めることから始めます。たとえば、元のシーケンスが AGTC の場合、反転シーケンスは CTGA になります。
- ヌクレオチドを相補的な塩基に置き換える: 各ヌクレオチドをその補体で置き換えます。
- アデニン (A) とチミン (T)
- チミン (T) とアデニン (A)
- シトシン (C) とグアニン (G)
- グアニン (G) とシトシン (C)
したがって、AGTC の逆相補体は TCAG です。
役立つ換算表
簡単に参照できるように、次の表を使用して各ヌクレオチドの相補的な塩基を見つけます。
オリジナルベース | 相補的なベース |
---|---|
A | T |
T | A |
C | G |
G | C |
この表は、DNA 配列を扱う人にとって便利なツールとして機能し、手動計算を行わずに迅速な変換を可能にします。
逆補数計算機の例
DNA 配列を考えてみましょう。 5'-ATGCCGTA-3'
。逆の補数を見つけるには:
- 順序を逆にします。
ATGCCGTA
になるATGCCGTA
. - 相補的な塩基を適用します:AT、TA、GC、CG。
結果として得られる逆補数: 5'-TACGGCAT-3'
.
最も一般的な FAQ
逆相補体は、元の DNA 鎖に対して相補的かつ逆平行な DNA 配列です。これは一致する配列を見つけるために使用され、さまざまな遺伝子配列決定アプリケーションに不可欠です。
逆相補を計算するには、式のセクションで詳しく説明されているように、DNA 配列全体を逆にして、各ヌクレオチドをその相補的な塩基に置き換えます。
電卓を使用すると間違いが最小限に抑えられ、コストが節約されます 時間、遺伝子研究の精度を高めます。これにより、多くの高度な遺伝子解析や手順において重要な、相補的配列を見つけるプロセスが簡素化されます。