この クローニングモル比計算機 is an essential tool for molecular biologists and genetic engineers. It helps in determining the optimal molar ratio of insert DNA to vector DNA required for successful ligation during cloning experiments. By ensuring precise ratios, this calculator maximizes the 効率 of DNA assembly, saving 時間 研究室のリソース。
このツールは、次のようなアプリケーションで特に役立ちます。
- 遺伝子クローニングと組み換え DNA 実験。
- タンパク質発現研究のためのベクター構築。
- 遺伝子スクリーニングのためのハイスループットクローニング。
クローニングの式 モル比計算機
インサート DNA とベクター DNA のモル比を計算する式は次のとおりです。
モル比 = 挿入 DNA のモル数 / ベクター DNA のモル数
各 DNA 成分のモル数を計算するには:
モル = 質量 (グラム) / モル質量 (g/mol)
壊す：
- 挿入DNAのモル数: DNA 挿入物の質量とモル質量から導出されます。
- ベクターDNAのモル数: ベクトルについても同様に計算します。
- 比: 結果の値は、ベクターと混合する挿入物の量をユーザーに指示します。
一般的なシナリオの事前計算された比率
ライゲーション実験で使用される一般的な挿入物とベクターの比率の表を以下に示します。
| 挿入DNAの質量（ng） | ベクターDNAの質量（ng） | 挿入:ベクターモル比 |
|---|---|---|
| 50 | 50 | 1:1 |
| 100 | 50 | 2:1 |
| 150 | 50 | 3:1 |
| 200 | 50 | 4:1 |
| 250 | 50 | 5:1 |
この表は、一般的な比率を簡単に参照できるようにし、繰り返し計算する必要がなくなります。
クローニングモル比計算機の例
連結反応のモル比を計算してみましょう。
- DNAを挿入: 100 ng、モル質量 = 2,000 g/mol。
- ベクターDNA: 50 ng、モル質量 = 3,000 g/mol。
ステップ 1: 挿入DNAのモル数を計算する:
挿入物のモル数 = 質量 / モル質量 = (100 × 10⁻⁹) / 2,000 = 5 × 10⁻⁸ モル。
ステップ 2: ベクターDNAのモル数を計算する:
ベクトルのモル数 = 質量 / モル質量 = (50 × 10⁻⁹) / 3,000 = 1.67 × 10⁻⁸ モル。
ステップ 3: モル比を計算します:
モル比 = インサートのモル数 / ベクターのモル数 = (5 × 10⁻⁸) / (1.67 × 10⁻⁸) ≈ 3:1。
モル比はおよそ 3:1 であり、これは最適な連結効率を得るための一般的な比率です。
最も一般的な FAQ
モル比は DNA ライゲーションの効率を決定します。不適切な比率ではライゲーションが不完全になったり、試薬が過剰に無駄になったりして、実験が失敗する可能性があります。
通常、インサートとベクターのモル比は 3:1 または 4:1 で、ほとんどのライゲーション反応に適しています。ただし、理想的な比率は DNA フラグメントのサイズとタイプによって異なる場合があります。
質量は大まかな推定値を提供しますが、DNA 断片の分子サイズを考慮するとモルを使用する方が正確です。これにより、ライゲーション反応の精度が向上します。