Le calculateur de pourcentage d'identité Blast est un outil essentiel en bioinformatique, couramment utilisé dans l'analyse des séquences d'ADN, d'ARN ou de protéines pour évaluer la similarité entre deux séquences alignées par une recherche BLAST. Ce calculateur fournit des informations essentielles sur les relations évolutives, l'identité des gènes et la prédiction des fonctions en quantifiant la correspondance exacte entre les séquences.
Formule du calculateur d'identité du pourcentage d'explosion
Pourcentage d'identité = (nombre de correspondances identiques / longueur d'alignement) * 100
Où :
- Nombre de correspondances identiques:Le nombre de positions dans l'alignement où les séquences ont exactement le même nucléotide ou acide aminé.
- Longueur d'alignement: Le nombre total de positions dans l'alignement, qui inclut les correspondances, les non-correspondances et les écarts qui se produisent pendant l'alignement.
Tableau de référence général
Pour fournir une référence rapide pour les scénarios typiques dans lesquels cette calculatrice est utilisée, le tableau suivant répertorie différents types de comparaisons de séquences et leurs plages d'identité en pourcentage attendues :
| Type de comparaison | Plage d'identité en pourcentage typique |
|---|---|
| Des gènes hautement conservés | 80 à 100 % |
| Gènes homologues chez différentes espèces | 40 à 80 % |
| Séquences aléatoires | Ci-dessous 10% |
Ce tableau aide les utilisateurs à estimer et à interpréter rapidement le pourcentage d’identité dans divers contextes biologiques et évolutifs.
Exemple de calculateur d'identité de pourcentage d'explosion
Imaginez un chercheur qui compare deux séquences d'ADN de différentes espèces pour déterminer leur degré de parenté. Si les résultats de l'alignement montrent 450 correspondances identiques sur une longueur d'alignement de 600 bases, le pourcentage d'identité serait calculé comme suit :
- Nombre de correspondances identiques = 450
- Longueur d'alignement = 600
Calcul:
- Pourcentage d'identité = (450/600) * 100 = 75 %
Ce résultat suggère une forte relation évolutive entre les deux espèces, reflétant un degré élevé de similitude dans les régions d’ADN comparées.
FAQ les plus courantes
Les espaces réduisent le pourcentage d’identité car ils augmentent la longueur d’alignement sans augmenter le nombre de correspondances identiques.
Un faible pourcentage d’identité indique généralement que les séquences ne sont pas étroitement liées, ce qui pourrait signifier qu’elles ont des fonctions différentes ou appartiennent à des lignées évolutives différentes.
Bien que le pourcentage d’identité puisse fournir des indices sur la similitude, les prédictions de la fonction des protéines nécessitent souvent des analyses plus détaillées, notamment les domaines conservés, la structure et les sites actifs.