Le calculateur de coefficient de coïncidence (COC) est un outil génétique utilisé pour mesurer dans quelle mesure les croisements doubles observés correspondent aux croisements doubles attendus dans un échantillon. Il aide les chercheurs à comprendre le phénomène d'interférence génétique, où un événement de croisement peut influencer l'apparition d'un autre à proximité. Ce calcul est essentiel en génétique pour cartographier les emplacements des gènes et étudier la recombinaison.
En utilisant le coefficient de coïncidence, les scientifiques peuvent mieux comprendre les mécanismes de l’hérédité génétique et les facteurs influençant les événements de croisement dans les chromosomes.
Formule du calculateur de coefficient de coïncidence
Le coefficient de coïncidence est calculé à l'aide de la formule :
COC = (Doubles croisements observés) / (Doubles croisements attendus)
Calcul des croisements doubles attendus
Pour déterminer les doubles croisements attendus, multipliez les fréquences de recombinaison individuelles des deux paires de gènes :
Doubles croisements attendus = Fréquence de recombinaison (paire de gènes 1) × Fréquence de recombinaison (paire de gènes 2)
Exemple de calcul
- Fréquences de recombinaison :
- Paire de gènes AB : 20 % (0.2)
- Paire de gènes CD : 10 % (0.1)
- Doubles croisements attendus :
- 0.2 × 0.1 = 0.02 (ou 2 %)
- Doubles croisements observés :
- Supposons 15 doubles croisements observés dans un échantillon de 1,000 XNUMX individus.
- Calcul du COC :
- COC = 15 / (1,000 0.02 × 0.75) = XNUMX
Interprétation
- COC = 1:Les doubles croisements se produisent aussi fréquemment que prévu, indiquant l'absence d'interférence.
- COC < 1:Une interférence est présente, ce qui signifie qu'un croisement en inhibe un autre à proximité.
- COC > 1:Rarement observé, indiquant une interférence positive, où un croisement en favorise un autre.
Tableau de référence pour une utilisation rapide
Voici un tableau résumant les valeurs typiques et les interprétations du coefficient de coïncidence :
| Valeur COC | Interprétation |
|---|---|
| 1.0 | Assortiment indépendant ; aucune interférence. |
| <1.0 | Présence d'interférences ; les croisements s'inhibent mutuellement. |
| > 1.0 | Interférence positive ; les croisements se favorisent mutuellement. |
Ce tableau sert de guide rapide pour comprendre les modèles de recombinaison génétique basés sur les valeurs COC.
Exemple de calculateur de coefficient de coïncidence
Calculons le coefficient de coïncidence pour le scénario suivant :
- Fréquence de recombinaison entre la paire de gènes AB : 15 % (0.15)
- Fréquence de recombinaison entre paires de gènes CD : 5 % (0.05)
- Doubles croisements observés : 8 dans un échantillon de 500 individus.
Étape 1 : Calculer les croisements doubles attendus
Croisements doubles attendus = 0.15 × 0.05 = 0.0075 (ou 0.75 %)
Croisements doubles attendus chez 500 individus : 0.0075 × 500 = 3.75
Étape 2 : Calculer le COC
COC = Doubles croisements observés / Doubles croisements attendus COC = 8 / 3.75 ≈ 2.13
Interprétation
Le COC de 2.13 suggère une interférence positive, où un croisement augmente la probabilité d'un autre à proximité.
FAQ les plus courantes
Une valeur COC inférieure à 1 indique une interférence, où un événement de croisement réduit la probabilité qu'un autre se produise à proximité.
Il fournit des informations sur les interférences génétiques et aide à cartographier les positions relatives des gènes sur les chromosomes en analysant les fréquences de recombinaison.
Bien que rare, un COC supérieur à 1 peut indiquer une interférence positive, où un événement de croisement facilite l'apparition d'un autre à proximité.