Esta calculadora ayuda a determinar el coeficiente de extinción molar (ε) de una proteína considerando las contribuciones de aminoácidos específicos que se sabe que absorben luz a 280 nm. Este cálculo es esencial para una cuantificación precisa de proteínas, que es fundamental en diversas aplicaciones bioquímicas, incluida la cinética enzimática y el diseño de fármacos.
La Fórmula
La fórmula para calcular el coeficiente de extinción molar (ε) de una proteína es:
- nW, Nueva York, Carolina del Norte: Número de residuos de triptófano, tirosina y cisteína, respectivamente.
- εW, εY, εC: Coeficientes de extinción molar para estos aminoácidos.
Los valores aproximados a 280 nm en agua son:
- Triptófano: ε ≈ 5600 M^-1 cm^-1
- Tirosina: ε ≈ 1280 M^-1 cm^-1
- Cisteína: ε ≈ 120 M^-1 cm^-1
Tabla de aplicaciones prácticas
| Aminoácidos | Coeficiente de extinción molar (M^-1 cm^-1) |
|---|---|
| El triptófano | 5600 |
| La tirosina | 1280 |
| La cisteína | 120 |
Esta tabla sirve como referencia rápida para cálculos comunes y ayuda a los usuarios a aplicar estos valores sin tener que calcular cada uno manualmente. time.
Ejemplo de cálculo
Consideremos una proteína con 10 residuos de triptófano, 5 de tirosina y 2 de cisteína. El cálculo sería:
ε = (10 * 5600) + (5 * 1280) + (2 * 120) = 56000 + 6400 + 240 = 62640 M^-1 cm^-1
Preguntas frecuentes más comunes
A: Este coeficiente es crítico para determinar la proteína. concentración en solución, que es necesario para ensayos y evaluaciones de pureza en la investigación.
A: Sí, siempre que conozca la cantidad de residuos de triptófano, tirosina y cisteína, puede utilizar esta fórmula para calcular el coeficiente.