La Calculadora de masa de péptidos es una herramienta especializada que se utiliza en bioquímica y biología molecular para calcular la masa molecular de un péptido a partir de su secuencia de aminoácidos. Esta herramienta es esencial para los investigadores y científicos que Trabaja con proteínas y péptidos, ya que ayuda a determinar con precisión la masa de péptidos, lo cual es crucial para diversos protocolos y procedimientos experimentales.
Calculadora de fórmula de masa de péptidos
Cálculo paso a paso:
- Lista de aminoácidos: Comience por identificar los aminoácidos presentes en la secuencia peptídica.
- Masas de aminoácidos: Utilice la masa monoisotópica estándar para cada aminoácido implicado en el péptido.
- Suma de masas de aminoácidos: Calcule la masa total sumando las masas monoisotópicas de todos los aminoácidos de la secuencia.
- Ajuste por pérdida de agua: Cuenta para el masa de agua moléculas (18.01528 Da por enlace peptídico) que se pierde durante la formación de enlaces peptídicos.
Masas de aminoácidos:
Aquí están las masas monoisotópicas de los 20 aminoácidos estándar, que son vitales para los cálculos:
| Aminoácidos | Símbolo | Masa monoisotópica (Da) |
|---|---|---|
| alanina | A | 71.03711 |
| Arginina | R | 156.10111 |
| Asparagina | N | 114.04293 |
| Ácido aspártico | D | 115.02694 |
| La cisteína | C | 103.00919 |
| La glutamina | Q | 128.05858 |
| El ácido glutámico | E | 129.04259 |
| Glicina | G | 57.02146 |
| Histidina | H | 137.05891 |
| Isoleucina | I | 113.08406 |
| La leucina | L | 113.08406 |
| Lisina | K | 128.09496 |
| Metionina | M | 131.04049 |
| La fenilalanina | F | 147.06841 |
| prolina | P | 97.05276 |
| serina | S | 87.03203 |
| Treonina | T | 101.04768 |
| El triptófano | W | 186.07931 |
| La tirosina | Y | 163.06333 |
| Valina | V | 99.06841 |
Cálculo final:
- Suma de masas de aminoácidos: Σ (Masa de cada aminoácido)
- Calcule el número de enlaces peptídicos: (n - 1), donde n es el número de aminoácidos en el péptido.
- Masa peptídica (M): Suma de masas de aminoácidos - (Número de enlaces peptídicos * 18.01528 Da)
Tabla de condiciones generales
| Término | Definición |
|---|---|
| Masa monoisotópica | La masa de una molécula utilizando el isótopo más abundante de cada elemento. |
| Enlace peptídico | un covalente químico Enlace que une dos monómeros de aminoácidos consecutivos a lo largo de una cadena peptídica o proteica. |
| Aminoácidos | Compuestos orgánicos que se combinan para formar proteínas, los componentes básicos de la vida. |
| Péptidos | Una cadena corta de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos. |
Ejemplo de calculadora de masa de péptidos
- Masas de aminoácidos:
- Glicina (G): 57.02146 Da
- Alanina (A): 71.03711 Da
- Leucina (L): 113.08406 Da
- Suma de masas de aminoácidos:
- 57.02146 + 71.03711 + 113.08406 = 241.14263 Da
- Número de enlaces peptídicos:
- 3 aminoácidos - 1 = 2 enlaces peptídicos
- Calcular la masa del péptido:
- 241.14263 - (2 * 18.01528) = 205.11207 Da
Este cálculo demuestra cómo determinar la masa peptídica de una secuencia simple.
Preguntas frecuentes más comunes
La exactitud depende en gran medida de la precisión de los valores de masa de aminoácidos proporcionados. Generalmente es muy confiable para cálculos teóricos.
No, la calculadora de masa peptídica estándar no tiene en cuenta las modificaciones postraduccionales. Se necesitan ajustes o herramientas adicionales para dichos cálculos.
Para proteínas grandes, la calculadora puede proporcionar una estimación aproximada, pero se recomiendan métodos más sofisticados como la espectrometría de masas para una mayor precisión.