DNA-Prozentrechner

Ein DNA-Prozentrechner ist ein Tool zur Analyse der Zusammensetzung einer DNA-Sequenz durch Berechnung des prozentualen Anteils jedes Nukleotids (Adenin, Thymin, Guanin und Cytosin). Er hilft außerdem bei der Bestimmung des GC-Gehalts, des AT-Gehalts, der Purin- und Pyrimidin-Zusammensetzung sowie des beobachteten/erwarteten CpG-Verhältnisses. Dieser Rechner ist unverzichtbar für die genetische Forschung, die Bioinformatik und das Verständnis von DNA-Eigenschaften.

Formel des DNA-Prozentrechners

Nukleotidanteil

Percentage of Nucleotide X = (Count of Nucleotide X / Total Number of Nucleotides) × 100

Wobei X A, T, G oder C (Adenin, Thymin, Guanin oder Cytosin) ist.

GC-Inhalt

GC Content (%) = ((Count of G + Count of C) / Total Number of Nucleotides) × 100

AT-Inhalt

AT Content (%) = ((Count of A + Count of T) / Total Number of Nucleotides) × 100

Puringehalt

Purine Content (%) = ((Count of A + Count of G) / Total Number of Nucleotides) × 100

Pyrimidingehalt

Pyrimidine Content (%) = ((Count of C + Count of T) / Total Number of Nucleotides) × 100

CpG-Verhältnis (beobachtet/erwartet)

CpG O/E Ratio = (Number of CpG × Total Number of Nucleotides) / (Count of C × Count of G)

Kennzahlen:

• Anzahl der CpG ist die Anzahl der CG-Dinukleotide in der Sequenz.
• Gesamtzahl der Nukleotide ist das Länge der Sequenz.
• Anzahl von C ist die Gesamtzahl der Cytosin-Nukleotide.
• Anzahl von G ist die Gesamtzahl der Guaninnukleotide.

Tabelle mit allgemeinen Begriffen

Beispiel für einen DNA-Prozentrechner

Betrachten wir die DNA-Sequenz: AGCTAGCTAGCTA

• Anzahl von A = 4
• Anzahl von T = 4
• Anzahl von G = 3
• Anzahl von C = 3
• Gesamtnukleotide = 14

Verwendung der Formeln:

• GC-Inhalt = ((3+3) / 14) × 100 = 42.86 %
• AT-Inhalt = ((4+4) / 14) × 100 = 57.14 %
• Puringehalt = ((4+3) / 14) × 100 = 50 %
• Pyrimidingehalt = ((3+4) / 14) × 100 = 50 %

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